最近要使用circos,分别在ubuntu和mac上面安装了~~还是遇到了一些麻烦的。
Ubuntu 和mac上面基本上都是一样地 ~
什么都不说了,直接下载,解压,然后cd到文件夹的 bin/目录中
./test.modules
如果显示都安装没问题,就好。否则,还要继续到CPAN上面下载需要的包
./circos
如果还有一些module没有装上,此时会显示
#### 更新 20160812 ####
最新的CPAN安装好像不太好用了
一个新的方法如下:
# 先安装cpanminuscurl -L http://cpanmin.us | perl - --sudo App::cpanminus# 再使用cpanminus进行安装sudo cpanm Some::Module
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只有GD是不能够直接从CPAN上面安装的
所以 google一下gd2.49即可,源码安装:
perl Makemodules.PL #如果有需要安装的包还会提醒你
make #如果有需要安装的包会提醒你
sudo make install
安装完GD
再./test.modules
看看有没有问题,如果一切OK
./ circos -man
能够运行的话酒没问题了~
注意这里:如果直接打 ./circos是会返回一些错误信息的。但是这没事,因为circos的运行是需要 .conf 文件的,你需要指定一个.conf文件
如果你没有制定,自然不能正确运行!
OK!
现在应该安装好了!